一、西瓜标记性状的类型及其应用（论文文献综述）
陈婕英[1]（2021）在《冬瓜果实形状的遗传分析与基因定位》文中进行了进一步梳理冬瓜是一种在我国广泛种植的葫芦科蔬菜,主要以果实作为食用器官,因此果实形状是冬瓜市场品质评价、分级的重要考察指标之一,也是育种家们重点关注的选育方向。冬瓜果实形状变异较大,形状丰富多样,然而关于冬瓜果实形状形成的分子调控机理还尚未清楚。本研究以果实形状差异显着的近圆球形冬瓜自交系MY-1和长圆柱形冬瓜自交系GX-71为亲本,构建4世代遗传群体（P1、P2、F1、F2）,采用植物数量性状主基因+多基因混合遗传模型分析方法对果实形状进行遗传规律研究;利用集群分离分析法（BSA-seq）并结合KASP分析定位控制冬瓜果实形状（果形指数）的候选基因。主要研究结果如下:1.冬瓜果实纵径、果实横径和果形指数属于多个基因共同控制的数量性状,果实纵径受2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因控制,主基因遗传率为82.61%;果实横径受2对等位-加性主基因+加性-显性多基因控制,主基因遗传率为38.22%;果形指数受2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因控制,主基因遗传率为97.03%。果实纵径、果实横径和果形指数之间呈极显着相关性。2.利用BSA-seq,将冬瓜果实形状（果形指数）调控基因初步定位于2号染色体50,830,000 bp-68,010,000 bp之间,区域总长度为17.18 Mb,共包含483个基因。3.在初定位基础上,通过KASP分析最终将调控冬瓜果实形状（果形指数）的候选基因精细定位于58,133,997 bp-58,153,568 bp之间,区域总长度为19,571 bp,该区域内只有一个注释基因Bch02G016830,初步认定Bch02G016830基因为冬瓜果实形状（果形指数）主效候选基因。通过亲本序列比对,发现Bch02G016830基因在近圆球形冬瓜MY-1上存在2个碱基的非同义突变。蛋白分析结果表明Bch02G016830基因属于IQD蛋白家族成员,推测通过影响细胞的数量和大小调控冬瓜果实形状。4.根据Bch02G016830基因的终止子开发了一个In Del标记In Del-CD8,将该标记在16份果实形状不同的冬瓜自交系中进行验证,发现该标记与冬瓜果实形状紧密连锁,验证准确率高达100%,可用于鉴定冬瓜的果实形状,为冬瓜分子标记辅助育种奠定基础。
郑英转[2]（2021）在《诱导四倍体马铃薯优良品种合作88降倍及其机制研究》文中指出马铃薯是茄科一年生草本植物,其种植范围广、适应性强,主要通过块茎进行无性繁殖,具有很高的营养价值,是世界上仅次于小麦和水稻的第三大粮食作物。在全球范围内,中国是最大的马铃薯生产国。马铃薯有多种倍性,其栽培种一般为四倍体,但在自然界中也大量存在其他倍性的马铃薯,例如二倍体、三倍体、五倍体、六倍体和八倍体等,这其中又以二倍体占比最多,它们具有不同的优良性状,是马铃薯育种工作中重要的种质资源。四倍体马铃薯品种较为单一,并且遗传背景相对狭窄、基因资源贫乏,野生二倍体染色体数目少、遗传背景简单,且具有抗病、抗虫等一系列优良性状。但由于染色体倍性的不同以及杂交不亲和等原因,栽培种四倍体无法直接与野生二倍体进行杂交,这就导致不能直接利用自然界丰富的野生二倍体资源。为了解决上述问题,就必须将四倍体栽培种进行降倍来产生双单倍体,利用双单倍体可以与野生二倍体直接进行杂交,最终获得相关优良性状。本研究主要利用四倍体优良品种“合作88”（C88）为母本、二倍体IVP101为父本进行了孤雌生殖诱导,最终在大约1600个后代群体中进行了双单倍体的筛选和鉴定,同时也初步探讨了其降倍机制。主要内容由如下几个方面:（1）成功做成降倍材料无菌苗820个编号。（2）改进了利用流式细胞仪分析马铃薯染色体倍性的方法,并用此方法检测了后代群体的染色体倍性。（3）通过气孔保卫细胞叶绿体计数法检测了部分后代群体的倍性。（4）通过根尖染色体计数法鉴定了部分后代群体的倍性。（5）对部分后代群体的表型性状进行了观察和分析。（6）鉴定部分后代群体的细胞质类型,同时也对其进行了SSR标记分析。（7）初步探究了后代群体的降倍机制。通过以上实验,最终获得了一套C88孤雌生殖诱导降倍的实验材料,其中包括二倍体、三倍体、四倍体以及多倍体甚至混倍体,可用于后续实验当中。同时,本研究也发现,孤雌生殖诱导后代中除了产生正常整倍性的后代之外,还产生非整倍体、多倍体和混倍体,其降倍机理复杂。本文在减数分裂形成配子的过程方面,以及亲本产生花粉大小方面,对其降倍机理做了初步的推测,在降倍的过程中可能既有孤雌生殖诱导,也有杂交、基因消除、基因渐渗等同时发生。本研究中,在有胚斑材料中检测到了二倍体,在无胚斑材料中也有三四倍体,这说明胚斑标记不能作为区分双单倍体唯一的方法。此外,本研究也对部分后代群体进行了细胞质类型检测和SSR标记检测。结果显示,后代群体的细胞质遗传大部分遵循母系遗传的规律,但也有一部分材料的细胞质遗传并不符合,尤其在线粒体遗传方面。SSR标记检测结果显示,后代群体中绝大部分材料与母本具有较高的亲缘关系,它们可能直接由母本配子发育而来,少部分后代群体中有父本基因组的参与。
范磊[3]（2020）在《甜瓜果柄长度QTL位点的初步分析》文中认为甜瓜（Cucumis melo L.）,葫芦科（Cucurbitaceae）甜瓜属（Cucumis L.）一年生蔓生植物。近年来随着甜瓜栽培面积的不断增加,产业化生产规模不断扩大,但是我国蔬菜生产成本也逐渐增加,尤其是大量人力物力的投入,造成较大的经济投入,“用工难”“用工贵”、机械化程度低是制约甜瓜规模化生产的重要因素。因次,设施栽培的规模化、机械化作业是甜瓜绿色生产上的一个的必然趋势。甜瓜果柄长度的研究对甜瓜机械化采收及提高生产力具有十分重要的意义。长果柄甜瓜一方面能够更好的利于机械化采收,提高机械化采收的准确率,另一方面更有利于甜瓜套袋,提升果实的外观和品质的同时还可以降低农药的残留,防止甜瓜的表面因药剂刺激而出现黄色斑点,影响甜瓜的商品性。本研究利用长果柄甜瓜1244和短果柄甜瓜MS-5杂交,配置杂交组合,获得F1、及F2分离群体,通过调查田间果柄长度分布规律,利用SLAF-seq测序技术构建甜瓜遗传图谱,分析果柄长度QTL位点的候选染色体,再利用较大F2群体结合SSR分子标记,对果柄长度性状QTL主效基因进一步定位,挖掘与甜瓜果柄长度相连锁的SSR分子标记,以期为甜瓜分子标记辅助选择育种提供理论基础,研究结果如下:1.对种植的甜瓜子蔓第五节位果柄长度进行调查并统计,结果显示F2群体果柄长度符合数量遗传分布,但出现了偏正态分布的双峰分布,偏度的绝对值大于0.5,推断甜瓜果柄长度性状存在主效基因。2.利用SLAF-seq（Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing）技术对甜瓜F2群体115个单株开展遗传图谱构建,利用Hpy166 II酶切组合方案进行酶切,SLAF标签长度选择264414 bp,预测到112,844个SLAF标签。通过对标签进行筛选和分型构建遗传连锁图谱,获得包括10,595个标记,图谱总长1,383.88cM的遗传连锁图谱,标记之间的平均距离0.13cM。初步得到到两个与甜瓜果柄长度相关的QTL分别为fsl1.1和fsl8.1,分别分布在第1和第8连锁群上。fsl1.1初步定位到LG1连锁群的;fsl8.1初步定位到LG8连锁群。3.利用已发表的SSR引物,在甜瓜第1和第8连锁群上每隔5cM选择一对SSR引物,最终筛选获得140对SSR引物,其中36对在亲本间存在多态性,分子标记的多态性频率为25.71%。以SLAF-seq测序技术定位甜瓜果柄长度候选区间为基础,利用该区间内具有多态性的SSR分子标记,以390个单株的F2群体为材料,对果柄长度QTL进行进一步定位分析,并挖掘与其连锁的SSR分子标记。结果显示,位于第1条染色体上fsl1.1,位于CMSSR05887和CMSSR05892之间,LOD值为4.2,表型贡献率为12.2%,加性效应为-0.24,QTL候选区间位于scaffold00060 57524至270836之间,该区间内共检测到20个基因;位于第8条染色体上fsl8.1,位于CMSSR20549与CMSSR20495间,LOD值为4.4,表型贡献率为13.2%,加性效应0.5,QTL候选区间位于CM3.5.1scaffold00058 94748至105498之间该区间内共检测到167个基因。
蔡佳秀[4]（2020）在《西瓜糖含量配合力分析及分子标记辅助选择》文中进行了进一步梳理我国西瓜栽培面积及产量均为世界首位,同时也是西瓜消费第一大国,糖含量是西瓜最为重要的品质性状,优异西瓜自交系是品种选育的基础,配合力和杂种优势是评价自交系育种价值的重要指标。优势组合的筛选是育种过程中的重要环节,在多种杂种优势预测方法的比较之下,配合力预测杂种优势相较而言简单、可行。本试验以7个西瓜品系为亲本,采用半双列杂交试验设计方法,对果糖含量、葡萄糖含量、蔗糖含量以及总糖含量进行配合力分析和杂种优势测定,选择出表现优良的亲本和杂交组合;同时,应用已开发的可溶性固形物分子标记BRX6-1,果糖分子标记Fru7-1,蔗糖分子标记Suc9-1,葡萄糖分子标记Glu6-1分别对57份西瓜种质材料进行扩增,验证标记的可靠性和稳定性,筛选出高糖的优良品系或组合,为西瓜品质育种和分子标记辅助育种研究奠定基础。主要试验结果如下:（1）西瓜亲本M1、M5的4种糖含量一般配合力效应值均为正值,且果糖、总糖为已测亲本中的最高值和次高值,综合表现良好,可以做为培育高糖西瓜新品种的亲本。（2）西瓜组合M2×N2的果糖含量特殊配合力效应值为3.1,葡萄糖含量特殊配合力效应值为0.18,蔗糖含量特殊配合力效应值为2.63,总糖含量特殊配合力效应值为5.57。4种糖含量性状中均呈现正向的特殊配合力效应值,且在除葡萄糖外的其他糖含量性状中均为最高值,综合表现佳,是表现优良的杂交组合。（3）西瓜组合M5×N1的果糖中亲优势为25.15%,葡萄糖中亲优势为26%,蔗糖中亲优势为64.66%,总糖中亲优势为32.8%;且果糖、蔗糖和总糖的中亲优势是所测组合中的最高值。M5×N1的果糖超亲优势为15.89%,葡萄糖超亲优势为17.66%,蔗糖超亲优势为9.42%,总糖超亲优势为15.74%;且果糖、葡萄糖和总糖的超亲优势是所测组合中的最高值。组合M5×N1综合表现佳,是表现优良的杂交组合。（4）果糖标记Fru7-1的有效性为57.9%;葡萄糖标记Glu6-1的有效性为54.4%;蔗糖标记Suc9-1的有效性为40.1%;总糖标记BRX6-1的有效性为31.2%。
朱春雨[5]（2020）在《西瓜短蔓基因Cldf的图位克隆》文中研究指明西瓜（Citrullus lanatus）,为葫芦科（Cucurbitaceae）西瓜属（Citrullus）,是一种重要的经济作物。株高是西瓜重要的的农艺性状,短蔓西瓜植株紧凑,蔓较短,适于高密度栽培,提高产量;在栽培和管理过程中,短蔓西瓜使西瓜生产更简约,省工省力。因此,开展对西瓜短蔓调控基因的精细定位与克隆研究,对培育短蔓西瓜新品种具有重要意义。本研究以短蔓“N21”、长蔓“M08”为亲本,构建F2代遗传群体,用于分析西瓜短蔓表型的遗传规律。分析表明N21的短蔓表型是由单隐性基因控制,命名为Cldf（Citrullus lanatus dwarfism）。同时,利用基因组重测序技术,完成西瓜短蔓基因的精细定位,确定赤霉素3-β-羟化酶编码基因Cla015407为Cldf的候选基因。主要试验结果如下:1. 相比于正常株系M08,矮化自交系N21蔓较短、株型紧凑、叶片较小。测量两个亲本及F1节间长度和株高,结果表明,N21的节间长度（4.0±0.8 cm,22个节间）远小于M08（9.6 cm±1.7 cm,22个节间）,而前者的株高（88.0±6.1 cm）也明显小于后者（211.6±8.9 cm）,正反交F1植株的株高和节间长度也显着高于短蔓N21,但低于正常株系M08,说明长蔓对短蔓为显性。群体蔓长形态统计发现,蔓长表型在苗期可明显区分,且在整个发育阶段明显分为短蔓或长蔓。2. 将亲本N21和M08通过正反交得到两个不同的F1代（N21×M08 F1和M08×N21 F1）。然后将F1进行自花授粉,每株单独收种,构建F2代分离群体,用于遗传分析和定位短蔓基因。统计正反交F2群体的蔓长分离数据,结果显示:在421株M08×N21F2群体中,长蔓植株有315株,短蔓植株有106株,比例3:1（c2=0.0008,p=0.93）符合孟德尔单基因遗传定律;在364株N21×M08 F2群体中,长蔓植株有266株,短蔓植株有98株,比例3:1（c2=0.62,p=0.40）也符合孟德尔单基因遗传定律。综上所述,N21的短蔓表型由单隐性基因控制,命名为Cldf。3. 本研究利用基因组重测序技术鉴定亲本基因SNP和Indels位点,共获得152,894个可靠的SNP和Indels位点,用于开发分子标记。在西瓜11条染色体上分别设计一条多态性标记扫描F2分离群体（96株）。连锁分析显示,9号染色体上的W12181817标记与短蔓Cldf位点连锁。随后,设计新的多态性标记确定群体（96株）的基因型,将短蔓基因定位在标记W1222182和W1221186之间,物理距离为235.67 kb。4. 用侧翼标记W01222182和W1221186对1996株群体进行基因分型,鉴定重组体,然后用4个高密度多态性分子标记扫描重组体,将基因Cldf定位在标记W1222183和W1222185之间,物理距离约为32.88 kb,并且获得育种上能辅助选种的共分离标记W1221184。5. 通过分析西瓜参考基因组（v1,97103）注释文件发现,候选区间内共有3个注释基因。结合序列分析及基因注释发现,在N21中,Cla015407内含子中的单核苷酸突变（G→A）影响内含子的原始剪接,导致Cldf的CDS存在13 bp的缺失,造成移码突变和翻译提前终止。此外,Cldf中参与酮戊二酸合成的保守区域Ny YPXCXXP也因翻译提前终止而缺失。因此,我们推断赤霉素3-β-羟化酶编码基因Cla015407为Cldf的候选基因。6. 利用实时荧光定量PCR技术,对候选基因Cla015407的组织特异性表达模式进行分析,结果表明Cla015407基因在亲本根、茎、叶、雄花和雌花中的表达模式相似;对GA合成和转导通路相关基因在亲本嫩茎的表达水平进行分析,结果表明:相比于M08,短蔓N21中CPS和KAO及3个GA20ox同源基因的转录水平均上调,说明可能存在反馈调节;2个Cl GID1s同源基因表现出不同的表达模式,表明它们可能具有不同的功能;在N21中5个DELLA同源基因中,只有基因Cla019759表达量被抑制。7. 对短蔓植株喷施外源GA3,结果发现外源GA3可以恢复短蔓表型,说明突变体N21为GA缺陷型突变体。8. 为了进一步研究GA3ox家族在植物中的进化,利用28个葫芦科GA3oxs和19个其他科同源基因构建了系统发育树。由系统发育树可知,该基因家族可被分成三组（I、II和III,其中II又可分为IIa、IIb亚组）,而亚组IIa只包含葫芦科GA3ox同源体,表明该亚组是葫芦科特有的。
王凯玥[6]（2020）在《西葫芦PRSV-W抗病基因紧密连锁分子标记的开发与育种应用》文中研究说明西葫芦（Cucurbita pepo L.）是葫芦科南瓜属重要的栽培蔬菜,世界范围内广泛种植,我国的栽培面积及产量均居世界首位。西葫芦适应性强、产量高、易管理、口感好、营养价值高,深受生产者和消费者的喜爱。目前,西葫芦设施栽培面积逐年增加,实现了周年供应。而生产方式的转变,也加重了病毒病等病害的危害。番木瓜环斑病毒病西瓜株系（PRSV-W）是危害西葫芦等葫芦科作物的主要病害之一,西葫芦植株被侵染后,出现花叶、泡斑、植株矮化、果实畸形等现象,可造成40%以上的产量损失,严重者甚至绝产。目前尚没有防治病毒病的有效药剂,培育抗病品种是防治PRSV-W病毒病最为经济、安全有效的措施。国内对西葫芦PRSV-W抗病鉴定技术及抗病种质鉴定的研究较少,导致抗性种质资源缺乏;同时传统抗病育种效率低、周期长,严重阻碍了抗病品种的选育,导致抗病品种少,满足不了生产需求。在前期初步探索工作的基础上,本研究进一步完善了西葫芦PRSV-W苗期抗性评价鉴定技术,对收集的西葫芦种质资源及当前主栽品种进行了抗性评价筛查,并构建六世代群体以揭示PRSV-W抗性遗传规律;进一步对西葫芦PRSV-W抗病基因进行了定位研究;开发了与PRSV-W抗病基因紧密连锁的分子标记并应用于西葫芦分子标记辅助选择育种。获得以下主要结果:1.西葫芦种质资源及主栽品种的抗性评价筛查及PRSV-W抗性遗传规律的揭示利用进一步完善的西葫芦PRSV-W苗期抗性评价鉴定技术体系,结合DAS-ELISA和RT-PCR检测技术,对收集的148份西葫芦品种及种质资源进行抗性评价筛查,获得抗PRSV-W病毒病材料33份,感病材料115份。其中,高代自交系“BV21”表现为高度抗病,接种PRSV-W病毒病后与对照无明显差异;自交系“BV37”表现为高度感病。利用这两个自交系配制六世代群体,并对单株进行抗性鉴定,结果显示:F1植株均表现为抗病;F2群体中137株抗病,55株感病,符合显性单基因控制性状的分离比例3:1（χ2=1.36,P=0.24）;BC1P1（F1×BV21）群体均为抗病,而BC1P2（F1×BV37）群体中,抗病与感病植株的分离比例为1:1。结果表明西葫芦材料“BV21”的PRSV-W抗性性状由一对显性抗病基因控制。2.PRSV-W抗病基因的定位利用897对SSR分子标记,在抗、感亲本间进行多态性分子标记筛查,获得149对具有多态性的分子标记。采用集群分离分析法（BSA）,利用筛选获得的亲本间多态性SSR分子标记对F2群体内植株进行分析,筛查获得4个与抗病基因CpPRSV-W紧密连锁的分子标记。其中,与抗病基因连锁最为紧密的标记SSR47,与抗病基因遗传距离为1.0 cM;另一侧的标记SSR113与抗病基因遗传距离为1.5cM;其余两个标记SSR21、SSR276遗传距离相对较远。为缩小抗病基因候选区间,进一步通过双亲重测序,在上述分子标记SSR47与SSR113之间开发新的InDel标记后筛查交换单株。最终将抗病基因CpPRSV-W定位在InDel标记ID523与ID1317之间,该区间包含753 Kb序列。根据西葫芦基因组注释信息,该候选区域包含30个候选基因。3.与PRSV-W抗病基因紧密连锁分子标记的开发及其在分子标记辅助选择育种中的应用在抗病基因候选区域内设计新的InDel标记,筛查获得多态性好、扩增稳定的分子标记ID307。利用ID307建立高效分子标记辅助选择育种技术,苗期对西葫芦抗病转育单株进行检测选择,淘汰非目标单株。自2018年以来,对西葫芦回交转育的四个批次植株材料,约20000株,进行苗期抗性筛查,获得6707株抗病植株。病毒接种鉴定结果显示,分子标记筛查获得的转育抗病植株获得了PRSV-W病毒病抗性。本文研究结果为PRSV-W抗病基因的高效利用、快速创制抗病西葫芦新种质及选育抗病新品种提供了技术支持,也为进一步分离鉴定抗病基因、揭示抗性分子机制奠定了基础。
武向斌[7]（2019）在《美洲南瓜全基因组SSR标记的开发和遗传多样性的分析》文中提出南瓜属历史悠久,是葫芦科一个重要的植物种群,包含种类较多,其中最常见的栽培种是中国南瓜（C.moschata）、印度南瓜（Cmaxima）和美洲南瓜（C.pepo）。南瓜不仅营养丰富,同时对多种疾病也有很好的预防作用,截止到2016年,我国南瓜种植面积已经达到了4.2×105 hm2,产量高达7.78×106吨。与葫芦科其它物种相比,我国关于南瓜的种质资源较少,市场上更是缺少优质品种,而分子标记辅助选择育种（MAS）可以不受环境影响,缩短育种年限,已经成为目前主流的育种方式。本研究从已经测序完成的中国南瓜、印度南瓜和美洲南瓜中进行了全基因组SSR标记的开发和引物设计,统计了不同SSR类型的频率和分布;同时利用电子PCR的方法,从中国南瓜、印度南瓜、西瓜、黄瓜和甜瓜基因组中开发了种间SSR标记,并与美洲南瓜进行了染色体的同源性分析。另外,根据已开发的标记选择96对SSR引物在葫芦科7个物种间进行通用性分析。最后,从已开发的标记中选择66对多态性好的引物对本实验室引进的61份美洲南瓜种质资源进行了遗传多样性分析。具体结果如下:1.从公布的中国南瓜、印度南瓜和美洲南瓜基因组中分别开发出34375、30577、38104个SSR标记,标记间的平均距离分别是127Mb、113Mb和145Mb,其中有29133个、28905个和36234个标记被设计成为SSR引物。结果表明美洲南瓜基因组标记密度最高。2.对二碱基重复至八碱基重复SSR进行了统计,结果表明,在3个基因组中,数量最多的是二碱基重复SSR,其余依次是:三碱基、四碱基、五碱基、七碱基、六碱基和八碱基重复SSR;各SSR类型在染色体上的数量呈随机分布。同时,对每种碱基重复类型SSR的重复次数进行统计,发现每种类型SSR的个数会随着重复次数的增多而逐渐减少。3.电子PCR结果表明,中国南瓜的种间SSR数量最多,达到15274个;黄瓜的种间SSR数量最少,只有391个。对这些种间SSR进行染色体比对,发现南瓜属3个物种之间染色体同源性很高,其中有8条染色体之间存在极高的同源性。4.利用96对引物在7个葫芦科作物之间进行通用性分析,其中有87对具有良好的多态性。这87对引物在作物之间的通用性比率范围是90.0%-96.6%,多态性比率的范围是5.7%48.2%,单一多态性比率的变化范围是0-12.6%;聚类结果与传统植物学分类的结果一致。证明本研究所选用的标记具有较高的通用性和多态性,也验证了葫芦科不同作物之间的亲缘关系远近。5.61份美洲南瓜15个形态学性状的多样性指数平均值为1.04,变异系数平均值为0.35;主成分分析可将15个性状综合成5个主成分,最大贡献率为18.794%,累积贡献率为67.741%;聚类分析可以按表型不同特征划分为6个类群。6.利用66对SSR引物在61份种质中共扩增出276个位点,平均每对引物扩增出4.18个位点;Na（观测等位基因）的变化范围为2-9,Ne（有效等位基因）的变化范围为1.03-1.67,香农信息指数（Ⅰ）平均值为0.83,多态性信息指数PIC值为0.43。试验结果表明,本研究所选用美洲南瓜遗传多样性丰富,在进行育种工作时可以加以筛选和利用;PIC值反映出SSR引物多态性很好。7.依据SSR标记可以将所有种质聚为两大类,其中类别Ⅰ包括5份野生种;类别Ⅱ包括56份栽培种;群体结构分析和主坐标分析结果表明所有种质同样可以按野生和栽培分为两个类群。
张乔玲[8]（2019）在《甜瓜重要性状分子标记辅助育种体系的建立》文中提出甜瓜重要性状分子标记辅助育种体系的建立对提高育种效率和种质创新都有非常重要的应用价值。当前我国甜瓜处于传统育种阶段,费力且周期长。本研究旨在建立一套高效、准确及经济的甜瓜重要性状分子标记辅助育种体系,该体系包括单性雌花分子标记的开发及应用、分子标记在甜瓜单性雌花前景及背景选择中的应用及分子标记辅助选择程序的优化。主要研究结果如下:1.开发了与单性雌花紧密连锁的In Del-1、In Del-5及SNP-KASP分子标记,对25份不同花性型材料进行基因型检测,结果显表型与基因型完全一致。将In Del标记应用于8个杂交的F2代分离群体中,可鉴定不同来源的单性雌花性状,符合率都在94%以上,准确率较高。2.在亲本Pa706和Pa631杂交的F2、F3及BC1F3群体进行单性雌花的前景选择及背景选择,将母本Pa706的单性雌花性状转育到父本Pa631中,选育与父本相似度较高的新种质材料。结果在F3代中得到与父本相似度高植株Pb549-16,将之与父本回交,回交群体父本基因组含量在73-91%,高效选育出了新种质材料。3.通过对甜瓜种子和子叶DNA提取及多重PCR检测等各环节优化,建立了重要性状分子标记辅助育种体系,并将该体系应用到优良性状聚合育种（单性雌花与橘肉）和商品种子纯度检测中,搭建了高效分子检测平台。成功开发了与单性雌花紧密连锁的In Del和SNP-KASP两种类型标记,将分子标记辅助育种技术应用到甜瓜种质创新背景选择中,选育了单性雌花新种质材料,并优化分子标记辅助选择程序,成功建立了一套高效、准确及经济的甜瓜重要性状分子标记辅助育种体系,将该体系应用到优良性状聚合育种和商品种子纯度检测中。
张晓雨[9]（2019）在《基于基因组测序信息的西瓜种脐斑性状的精细定位》文中研究指明西瓜为葫芦科一年生蔓生藤本植物。水分充足、营养价值高,是世界上夏季经常食用的水果之一。西瓜种脐斑是指种脐部位有无和种子表面不一致的颜色,该性状可稳定遗传。一方面,该性状在西瓜资源、品种鉴定和遗传分类方面有一定的指导意义;另一方面,利用分子标记确定与种脐斑紧密连锁的标记,可为今后西瓜分子标记辅助育种提供思路与技术支撑。但就目前国内外研究现状,尚未有关于种脐斑性状基因精细定位的文献报道。本研究中,利用栽培西瓜品系B135（有种脐斑）作为父本与栽培西瓜品系B132（无种脐斑）作为母本杂交获得F1代B139,B139与B132回交获得BC1群体,通过BC1群体98个单株的性状形态学观察,分析其遗传规律。基于RAD-seq技术和QTL-seq技术,完成对种脐斑性状的初步区间定位。随后通过分子标记,在BC1群体94个单株（去除4个无法鉴定的单株）与B5-8、18CB83共96个单株的构图群体内筛选验证,逐步缩小QTL初定位的物理区域,在最终确定的区域内结合生物信息学分析,确定候选基因。在候选基因上设计开发分子标记应用于构图群体,查看该标记的准确率。对候选基因进行实时荧光定量PCR,以检测基因表达水平。利用候选基因上的分子标记应用于71份材料的种质资源群体,加以验证。取得以下实验成果:（1）F1代B139具有种脐斑,通过对BC1群体98个单株种脐斑的统计分析,结果显示BC1群体具有种脐斑性状多态性,其中46株有种脐斑,48株无种脐斑,4株因种皮颜色过暗无法识别,符合孟德尔遗传分离比1:1。由此推断西瓜种脐斑性状由一个主效QTL控制。（2）基于RAD-seq和QTL-seq分析,结合BC1群体表型结果,在3号连锁群鉴定到一个西瓜种脐斑主效QTL,LOD值为3.87,解释88.01%的表型变异率,对应物理区间为53660425784364 bp。（3）在QTL置信区间内,共开发22个Indel标记,经亲本筛选得到具有多态性的Indel标记11个,在构图群体内进行验证,将初定位区间缩小至分子标记Zshpr84和Zshpr87间,即5.69-5.73Mb的范围内,约40Kb。（4）在40Kb区间内,生物信息学分析发现仅有一个基因,即为Cla019481。结合基因注释和序列分析,确定Cla019481为西瓜种脐斑性状的候选基因,在Cla019481上开发dCAPS标记Zshpr101在构图群体内验证,基因型与表型符合率为100%。（5）利用qRT-PCR技术,在不同发育时期验证有种脐斑种子与无种脐斑种子候选基因Cla019481的表达水平,结果显示,不同发育时期,Cla019481在有种脐斑种子内表达水平显着升高,在无种脐斑种子内无明显差异。证明Cla019481为控制西瓜种脐斑性状的主效基因。（6）利用dCAPS分子标记Zshpr101在71份材料的种质资源群体中验证,基因型与表型符合率为69%。
屈海泳,张朝阳,刘连妹,王永章[10]（2017）在《西瓜抗枯萎病苗期性状的选择》文中研究指明西瓜枯萎病是西瓜的主要病害之一,通过对苗期叶片喷施过氧化氢（化学式H2O2）检测叶片温度、叶片气孔面积和毛状物数量,从抗病品系和敏感品系中找出差异。结果表明,苗龄为1015 d的幼苗,叶片喷施H2O2处理后,与对照相比,抗病品系叶片温度下降极显着,而感病品系叶片温度下降不明显;处理后25 d的幼苗气孔面积增加0.03 mm2,而感病品系面积减少0.026 mm2;叶片表皮毛的毛状物数量无论是抗病品系还是感病品系处理与对照相比均极显着降低。表明叶片温度和叶片气孔面积可以作为西瓜抗枯萎病的苗期标记性状,而表皮毛不能作为西瓜抗枯萎病的苗期标记性状。
二、西瓜标记性状的类型及其应用（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、西瓜标记性状的类型及其应用（论文提纲范文）
（1）冬瓜果实形状的遗传分析与基因定位（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 第一章 前言 |
| 1.1 植物性状遗传研究 |
| 1.1.1 质量性状遗传 |
| 1.1.2 数量性状遗传 |
| 1.1.3 植物数量性状主基因+多基因混合遗传模型应用 |
| 1.2 植物性状定位方法研究 |
| 1.2.1 BSA分析 |
| 1.2.2 遗传图谱构建 |
| 1.2.3 QTL定位 |
| 1.3 冬瓜果实形状相关研究进展 |
| 1.3.1 园艺作物果实形状遗传规律研究进展 |
| 1.3.2 冬瓜果实形状遗传规律研究进展 |
| 1.3.3 园艺作物果实形状基因定位研究进展 |
| 1.3.4 冬瓜果实形状基因定位研究进展 |
| 1.3.5 研究目的及意义 |
| 第二章 冬瓜果实形状遗传分析 |
| 2.1 试验材料 |
| 2.2 试验方法 |
| 2.2.1 田间试验 |
| 2.2.2 冬瓜果实形状的测定 |
| 2.2.3 冬瓜果实形状的遗传分析 |
| 2.2.4 冬瓜果实形状的细胞学观察 |
| 2.3 结果与分析 |
| 2.3.1 冬瓜果实形状的遗传分析 |
| 2.3.2 最优模型的选择和检验 |
| 2.3.3 最优模型的遗传参数估计 |
| 2.3.4 冬瓜发育过程中果实形状的变化分析 |
| 2.3.5 冬瓜果实形状的细胞学观察 |
| 2.4 讨论 |
| 第三章 冬瓜果实形状(果形指数)调控基因定位 |
| 3.1 试验材料 |
| 3.2 试验方法 |
| 3.2.1 冬瓜DNA提取及检测 |
| 3.2.2 BSA极端混池构建 |
| 3.2.3 文库构建和测序 |
| 3.2.4 冬瓜果实形状(果形指数)基因的BSA分析 |
| 3.2.5 冬瓜果实形状(果形指数)候选基因注释 |
| 3.2.6 冬瓜亲本材料RNA提取 |
| 3.2.7 RNA反转录和PCR扩增 |
| 3.2.8 载体构建 |
| 3.3 结果与分析 |
| 3.3.1 重测序数据分析 |
| 3.3.2 冬瓜果实形状(果形指数)基因初定位 |
| 3.3.3 冬瓜果实形状(果形指数)候选区域内基因功能注释 |
| 3.3.4 冬瓜果实形状(果形指数)候选基因的精细定位 |
| 3.3.5 冬瓜果实形状(果形指数)候选基因的克隆 |
| 3.3.6 冬瓜果实形状(果形指数)候选基因的蛋白分析 |
| 3.3.7 冬瓜果实形状(果形指数)连锁标记的开发及应用 |
| 3.4 讨论 |
| 第四章 全文结论 |
| 4.1 主要结论 |
| 4.2 创新之处 |
| 4.3 后续的研究及展望 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 攻读学位期间发表论文情况 |
（2）诱导四倍体马铃薯优良品种合作88降倍及其机制研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 术语及符号说明 |
| 第一章 绪论 |
| 1.1 马铃薯概述 |
| 1.2 马铃薯双单倍体的研究意义 |
| 1.3 马铃薯双单倍体的诱导方法 |
| 1.4 鉴定马铃薯双单倍体的方法 |
| 1.4.1 胚斑标记鉴定 |
| 1.4.2 染色体计数法 |
| 1.4.3 气孔大小及保卫细胞叶绿体数目 |
| 1.4.4 花粉粒鉴定 |
| 1.4.5 植株形态鉴定 |
| 1.4.6 生理生化指标的鉴定 |
| 1.4.7 流式细胞术分析法 |
| 1.4.8 分子标记鉴定 |
| 1.5 本研究的主要目的和研究内容 |
| 第二章 孤雌生殖诱导群体的建立 |
| 2.1 引言 |
| 2.2 材料和方法 |
| 2.2.1 孤雌诱导后代种子的获得 |
| 2.2.2 种薯获得 |
| 2.2.3 无菌苗的获得 |
| 2.2.4 试剂配制 |
| 2.2.5 无菌苗制作过程 |
| 2.3 试验结果 |
| 第三章 流式细胞术检测马铃薯染色体倍性实验方法的改进 |
| 3.1 引言 |
| 3.2 材料和方法 |
| 3.2.1 实验材料 |
| 3.2.2 实验方法 |
| 3.3 结果与分析 |
| 3.3.1 不同方法制备细胞核悬液的效果比较 |
| 3.3.2 液氮研磨法中不同染色时间的效果比较 |
| 3.3.3 利用已知倍性马铃薯材料检验液氮研磨法的可靠性 |
| 3.4 讨论 |
| 3.5 小结 |
| 第四章 孤雌诱导后代群体的表型性状及染色体组倍性鉴定 |
| 4.1 引言 |
| 4.2 材料和方法 |
| 4.2.1 流式细胞术检测相关材料方法 |
| 4.2.2 气孔保卫细胞叶绿体数目统计相关材料方法 |
| 4.2.3 根尖染色体计数相关材料方法 |
| 4.3 无胚斑材料结果与分析 |
| 4.3.1 流式细胞术检测鉴定结果 |
| 4.3.2 保卫细胞叶绿体数目统计鉴定结果 |
| 4.3.3 根尖染色体计数鉴定结果 |
| 4.3.4 三种不同方法鉴定结果汇总 |
| 4.3.5 不同倍性材料植株的表型性状观察 |
| 4.4 有胚斑材料的结果与分析 |
| 4.5 讨论 |
| 4.6 小结 |
| 第五章 细胞质类型鉴定 |
| 5.1 引言 |
| 5.2 材料和方法 |
| 5.2.1 试验材料 |
| 5.2.2 DNA提取(CTAB法) |
| 5.2.3 细胞质类型鉴定过程 |
| 5.2.4 细胞质类型判断标准 |
| 5.3 结果与分析 |
| 5.4 讨论 |
| 5.5 小结 |
| 第六章 SSR分子标记检测及分析 |
| 6.1 引言 |
| 6.2 材料和方法 |
| 6.2.1 主要试剂 |
| 6.2.2 DNA提取 |
| 6.2.3 引物以及PCR |
| 6.2.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳 |
| 6.3 结果与分析 |
| 6.4 讨论 |
| 6.5 小结 |
| 第七章 孤雌生殖诱导四倍体马铃薯C88 降倍的可能机制 |
| 7.1 引言 |
| 7.2 材料与方法 |
| 7.2.1 采集花粉 |
| 7.2.2 染色液的配制 |
| 7.2.3 检测方法 |
| 7.3 实验结果 |
| 7.3.1 亲本C88和IVP101 花粉直径大小检测及DNA含量检测 |
| 7.3.2 后代群体中存在混合倍性的材料 |
| 7.4 讨论与结论 |
| 第八章 总结与展望 |
| 参考文献 |
| 附录 A |
| 附录 B |
| 攻读学位期间发表的学术论文和研究成果 |
| 致谢 |
（3）甜瓜果柄长度QTL位点的初步分析（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 1 文献综述 |
| 1.1 研究的目的意义 |
| 1.2 甜瓜生产中存在的问题 |
| 1.3 果柄性状研究及基因定位 |
| 1.3.1 果柄的概念 |
| 1.3.2 果柄性状研究进展 |
| 1.3.3 葫芦科作物果柄性状研究现状 |
| 1.4 分子标记及其辅助选择育种 |
| 1.4.1 分子标记 |
| 1.4.2 遗传图谱的构建及应用 |
| 1.4.3 QTL基因定位技术 |
| 1.4.4 分子标记辅助选择育种的研究进展 |
| 1.5 研究的主要内容及方法 |
| 1.5.1 研究目标 |
| 1.5.2 研究内容 |
| 1.5.3 技术路线 |
| 2 材料与方法 |
| 2.1 试验材料 |
| 2.2 试验药品及仪器 |
| 2.2.1 试验试剂 |
| 2.2.2 试验仪器 |
| 2.3 试验方法 |
| 2.3.1 田间试验方法 |
| 2.3.2 SLAF测序及果柄长度QTL候选染色体分析 |
| 2.3.3 果柄长度性状QTL分析 |
| 2.4 数据分析 |
| 2.4.1 田间性状数据的处理 |
| 2.4.2 分子标记数据分析 |
| 3 结果与分析 |
| 3.1 田间试验 |
| 3.1.1 表型分析 |
| 3.1.2 果柄长度性状的频次分布 |
| 3.2 SLAF测序初步分析果柄长度性状QTL候选染色体区域分析 |
| 3.2.1 SLAF-seq遗传图谱构建 |
| 3.2.2 果柄长度QTL初步分析 |
| 3.3 SSR分子标记分析果柄长度主效QTL位点 |
| 3.3.1 甜瓜基因组DNA的提取 |
| 3.3.2 SSR引物在亲本中的多态性 |
| 3.3.3 多态性标记在F2 群体中的扩增 |
| 3.3.4 利用SSR分子标记构建遗传图谱 |
| 3.3.5 利用SSR引物对甜瓜果柄长度的初步定位 |
| 3.3.6 QTL位点候选区域相关基因 |
| 4 讨论 |
| 4.1 果柄长度F_2 分布分析 |
| 4.2 SLAF-seq测序及标记的开发 |
| 4.3 甜瓜遗传图谱的构建及其应用 |
| 4.4 SSR分子标记分析果柄长度QTL位点 |
| 4.4.1 DNA的提取 |
| 4.4.2 SSR分子标记的PCR扩增 |
| 4.4.3 QTL定位 |
| 4.5 QTL位点候选区域相关基因 |
| 5 结论 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 个人简历 |
| 附录 |
（4）西瓜糖含量配合力分析及分子标记辅助选择（论文提纲范文）
| 摘要 |
| 英文摘要 |
| 1 前言 |
| 1.1 研究的目的与意义 |
| 1.2 西瓜的种质资源与育种 |
| 1.2.1 西瓜种质资源研究 |
| 1.2.2 西瓜育种研究 |
| 1.3 西瓜糖含量研究进展 |
| 1.3.1 果实糖分的积累 |
| 1.3.2 西瓜糖含量研究进展 |
| 1.3.3 糖含量的测定 |
| 1.4 杂种优势的研究与预测 |
| 1.4.1 杂种优势 |
| 1.4.2 杂种优势研究进展 |
| 1.4.3 杂种优势预测 |
| 1.4.4 配合力预测杂种优势 |
| 1.5 杂种优势在西瓜育种中的研究现状 |
| 1.6 分子标记在西瓜育种中的应用 |
| 1.6.1 西瓜分子标记在西瓜育种的应用 |
| 1.6.2 西瓜糖含量遗传图谱的构建 |
| 1.6.3 西瓜糖含量QTL研究进展 |
| 1.6.4 分子标记辅助选择 |
| 1.7 研究内容和技术路线 |
| 2 材料与方法 |
| 2.1 田间试验 |
| 2.1.1 试验材料 |
| 2.1.2 试验设计 |
| 2.1.3 糖含量的测定 |
| 2.1.4 表型数据的统计分析 |
| 2.1.5 试验药品与仪器 |
| 2.2 分子标记验证试验 |
| 2.2.1 试验材料 |
| 2.2.2 试验设计 |
| 2.2.3 试验方法 |
| 2.2.4 数据分析方法 |
| 2.2.5 试验药品与仪器 |
| 3 结果与分析 |
| 3.1 西瓜糖含量性状测定结果 |
| 3.2 西瓜糖含量统计分析 |
| 3.2.1 西瓜亲本糖含量统计分析 |
| 3.2.2 西瓜杂交组合糖含量统计分析 |
| 3.3 西瓜含糖量性状方差分析 |
| 3.4 配合力方差分析 |
| 3.5 配合力效应值分析 |
| 3.5.1 一般配合力效应值分析 |
| 3.5.2 特殊配合力效应值分析 |
| 3.6 杂种优势分析 |
| 3.7 利用分子标记筛选西瓜种质含糖量 |
| 3.7.1 供试西瓜种质含糖量分析 |
| 3.7.2 利用分子标记对西瓜种质含糖量进行筛选 |
| 4 讨论 |
| 4.1 西瓜糖含量性状测定值 |
| 4.2 西瓜糖含量的配合力 |
| 4.3 西瓜糖含量的杂种优势 |
| 4.4 分子标记在西瓜育种中的应用 |
| 5 结论 |
| 致谢 |
| 参考文献 |
（5）西瓜短蔓基因Cldf的图位克隆（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 第一章 文献综述 |
| 1.1 植物矮生性状的研究进展 |
| 1.2 葫芦科作物矮生性状的研究进展 |
| 1.2.1 南瓜矮生性状的研究进展 |
| 1.2.2 黄瓜矮生性状的研究进展 |
| 1.2.3 甜瓜矮生性状的研究进展 |
| 1.2.4 西瓜矮生性状的研究进展 |
| 1.3 与赤霉素相关的植物矮化机理 |
| 1.4 分子标记与基因组重测序技术 |
| 1.5 目的和意义 |
| 第二章 材料与方法 |
| 2.1 试验材料 |
| 2.2 试验试剂 |
| 2.3 试验方法 |
| 2.3.1 田间试验设计 |
| 2.3.2 蔓长形态鉴定和遗传分析 |
| 2.3.3 两个亲本的全基因组重测序 |
| 2.3.4 数据分析和标记开发 |
| 2.3.5 基因定位 |
| 2.3.6 候选基因预测和通路相关基因鉴定 |
| 2.3.7 RNA提取和RT-PCR分析 |
| 2.3.8 喷施外源GA3对短蔓植株的影响 |
| 2.3.9 GA3ox同源基因鉴定与进化分析 |
| 第三章 结果与分析 |
| 3.1 蔓长性状的表型特征和遗传分析 |
| 3.2 全基因组SNP和 Indels的鉴定 |
| 3.3 矮化基因Cldf的初定位 |
| 3.4 矮化基因Cldf的精细定位 |
| 3.5 短蔓基因Cldf的鉴定 |
| 3.6 组织特异性表达及GA通路基因表达分析 |
| 3.7 外源GA3对短蔓表型的恢复作用 |
| 3.8 候选基因Cldf的进化分析 |
| 第四章 讨论 |
| 第五章 结论 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 致谢 |
| 个人简历 |
（6）西葫芦PRSV-W抗病基因紧密连锁分子标记的开发与育种应用（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 英文缩略表 |
| 第一章 前言 |
| 1.1 西葫芦概述 |
| 1.2 西葫芦病毒病类型及流行原因 |
| 1.3 番木瓜环斑病毒的研究进展 |
| 1.3.1 株系划分、寄主范围和传播方式 |
| 1.3.2 分布与危害 |
| 1.3.3 抗病性鉴定和检测技术 |
| 1.3.4 西葫芦PRSV-W病毒病的防治 |
| 1.4 抗病种质筛查与抗病性状遗传规律 |
| 1.4.1 种质资源的筛选与利用 |
| 1.4.2 抗性遗传规律分析 |
| 1.5 分子标记技术及应用 |
| 1.5.1 分子标记概述 |
| 1.5.2 分子标记主要方法 |
| 1.5.3 PCR技术 |
| 1.5.4 分子标记技术在植物抗病育种中的应用 |
| 1.6 研究目的及意义 |
| 第二章 西葫芦PRSV-W抗病种质鉴定及抗性遗传规律分析 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 试验材料 |
| 2.1.2 试验工具 |
| 2.1.3 PRSV-W苗期接种鉴定 |
| 2.1.4 病毒病的DAS-ELISA及 RT-PCR检测 |
| 2.1.5 荧光定量PCR |
| 2.1.6 试验结果统计分析 |
| 2.2 结果与分析 |
| 2.2.1 西葫芦PRSV-W病毒病苗期人工接种抗性评价 |
| 2.2.2 西葫芦PRSV-W抗病种质鉴定筛查 |
| 2.2.3 西葫芦PRSV-W抗病性状遗传分析 |
| 2.3 结论与讨论 |
| 2.3.1 西葫芦PRSV-W抗病种质的评价鉴定 |
| 2.3.2 西葫芦PRSV-W病毒病的抗性遗传规律 |
| 第三章 西葫芦PRSV-W抗病基因紧密连锁分子标记的开发 |
| 3.1 材料与方法 |
| 3.1.1 试验材料 |
| 3.1.2 试验仪器与试剂 |
| 3.1.3 PRSV-W苗期接种技术 |
| 3.1.4 西葫芦DNA提取 |
| 3.1.5 西葫芦DNA质量和浓度检测 |
| 3.1.6 PCR扩增 |
| 3.1.7 聚丙烯酰胺凝胶电泳的检测与银染 |
| 3.1.8 0.8%琼脂糖凝胶电泳: |
| 3.1.9 试验结果统计分析 |
| 3.2 结果与分析 |
| 3.2.1 DNA样品质量检测 |
| 3.2.2 抗、感亲本间多态性分子标记的筛查 |
| 3.2.3 抗病基因定位 |
| 3.3 结论与讨论 |
| 第四章 PRSV-W抗病基因紧密连锁分子标记在西葫芦抗病育种中的应用 |
| 4.1 材料与方法 |
| 4.1.1 试验材料 |
| 4.1.2 试验方法 |
| 4.2 PCR扩增及电泳检测分析 |
| 4.3 试验结果统计分析 |
| 4.4 结果与分析 |
| 4.4.1 亲本间分子标记适用性筛查 |
| 4.4.2 西葫芦PRSV-W抗病种质检测 |
| 4.5 讨论 |
| 4.5.1 西葫芦PRSV田间抗病种质检测 |
| 4.5.2 分子标记辅助育种在抗病育种中的应用 |
| 结论与展望 |
| 致谢 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 作者简历 |
（7）美洲南瓜全基因组SSR标记的开发和遗传多样性的分析（论文提纲范文）
| 致谢 |
| 摘要 |
| 1 文献综述 |
| 1.1 南瓜属起源与生产现状 |
| 1.1.1 南瓜属起源与传播 |
| 1.1.2 南瓜的种类和生产现状 |
| 1.1.3 南瓜的产业现状及育种进展 |
| 1.2 分子标记的研究 |
| 1.2.1 分子标记技术的发展 |
| 1.2.2 SSR分子标记的研究进展 |
| 1.2.3 南瓜属分子标记研究进展 |
| 1.3 南瓜属遗传多样性研究 |
| 1.3.1 遗传多样性的概念及研究意义 |
| 1.3.2 遗传多样性研究方法 |
| 1.3.3 遗传多样性研究进展 |
| 1.4 本研究的目的和意义 |
| 2 南瓜属测序物种全基因组SSR标记的开发及分析 |
| 2.1 试验材料和方法 |
| 2.1.1 试验材料 |
| 2.1.2 试验主要试剂和配制方法 |
| 2.1.3 试验仪器 |
| 2.2 试验方法 |
| 2.2.1 葫芦科全基因组SSR位点的鉴定与开发 |
| 2.2.2 电子PCR (in silico PCR)及物种间SSR标记的线性化关系分析 |
| 2.2.3 基因组DNA提取 |
| 2.2.4 PCR扩增 |
| 2.2.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳 |
| 2.2.6 聚类运算 |
| 2.3 结果分析 |
| 2.3.1 基因组中不同SSR类型分布 |
| 2.3.2 南瓜属测序物种中每条染色体上不同类型SSR标记的分布情况比较与分析 |
| 2.3.3 美洲南瓜全基因SSR标记在葫芦科物种间和南瓜属物种内的相关性比较与分析 |
| 2.4 SSR标记在葫芦科不同作物间的通用性分析 |
| 2.5 讨论 |
| 3 美洲南瓜遗传多样性分析 |
| 3.1 试验材料 |
| 3.1.1 材料来源 |
| 3.1.2 所选引物 |
| 3.1.3 试验试剂及配制方法 |
| 3.1.4 试验仪器 |
| 3.2 试验方法 |
| 3.2.1 田间种植 |
| 3.2.2 田间性状调查标准 |
| 3.2.3 基因组DNA提取和质量检测 |
| 3.2.4 PCR扩增程序 |
| 3.2.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳 |
| 3.3 数据统计和运算方法 |
| 3.3.1 表型数据统计和运算 |
| 3.3.2 SSR条带统计和运算 |
| 3.4 结果分析 |
| 3.4.1 表型数据分析 |
| 3.4.2 SSR标记的遗传多样性分析 |
| 3.5 讨论 |
| 参考文献 |
| Abstract |
| 附录 |
（8）甜瓜重要性状分子标记辅助育种体系的建立（论文提纲范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 第1章 绪论 |
| 1.1 甜瓜单性雌花性状遗传研究进展 |
| 1.2 甜瓜果肉颜色性状遗传研究进展 |
| 1.3 分子标记技术及其应用现状 |
| 1.3.1 SSR标记技术及其应用 |
| 1.3.2 InDel标记技术及其应用 |
| 1.3.3 SNP标记技术及其应用 |
| 1.4 分子标记辅助回交育种的研究进展 |
| 1.4.1 前景选择 |
| 1.4.2 背景选择 |
| 1.5 分子标记辅助聚合育种技术 |
| 1.6 本研究内容、目的及意义 |
| 1.6.1 研究内容 |
| 1.6.2 研究目的、意义及创新点 |
| 1.6.3 技术路线 |
| 第2章 甜瓜单性雌花性状In Del及 KASP标记的开发及应用 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 实验材料 |
| 2.1.2 单性雌花性状鉴定 |
| 2.1.3 DNA的提取及检测 |
| 2.1.4 仪器设备 |
| 2.1.5 In Del分子标记PCR扩增体系 |
| 2.1.6 SNP-KASP扩增体系及检测 |
| 2.1.7 聚丙烯酰胺凝胶电泳 |
| 2.1.8 快速银染 |
| 2.2 结果与分析 |
| 2.2.1 In Del-1、In Del-5及SNP-KASP分子标记的开发 |
| 2.2.2 InDel分子标记的验证 |
| 2.2.3 SNP-KASP分子标记的验证 |
| 2.2.4 In Del-1 对甜瓜F2群体单性雌花的应用与分析 |
| 2.2.5 In Del-5 对甜瓜F2群体单性雌花的应用与分析 |
| 2.3 讨论 |
| 2.4 小结 |
| 第3章 分子标记在甜瓜单性雌花前景及背景选择中的应用 |
| 3.1 材料及方法 |
| 3.1.1 单性雌花性状后代群体背景选择程序 |
| 3.1.2 基因组DNA的提取、PCR扩增及电泳检测 |
| 3.1.3 多态性标记的筛选与合成 |
| 3.1.4 单性雌花CmACS-7基因前景选择 |
| 3.1.5 F2、F3及BC1F3回交群体的基因组背景选择 |
| 3.1.6 表型性状调查 |
| 3.1.7 表型与基因型的聚类分析 |
| 3.2 结果与分析 |
| 3.2.1 背景选择标记的获得 |
| 3.2.2 单性雌花状的前景选择 |
| 3.2.3 F2代分子标记辅助背景选择 |
| 3.2.4 F2相关性状的调查 |
| 3.2.5 F2基因型与表型聚类分析 |
| 3.2.6 F3代群体的背景选择 |
| 3.2.7 F3代群体的表型调查 |
| 3.2.8 F3基因型与表型聚类分析 |
| 3.2.9 背景选择在BC1F3代群体中的应用 |
| 3.3 讨论 |
| 3.4 小结 |
| 第4章 重要性状分子标记辅助育种体系的建立 |
| 4.1 分子标记辅助选择程序的优化 |
| 4.1.1 甜瓜种子和子叶DNA提取的优化 |
| 4.1.2 多重PCR检测的优化 |
| 4.2 重要性状分子标记辅助育种体系的建立及应用 |
| 4.2.1 重要性状分子标记辅助育种体系的建立 |
| 4.2.2 优良性状聚合育种(单性雌花与橘肉) |
| 4.2.3 商品种子纯度纯度检测 |
| 4.3 讨论 |
| 4.4 小结 |
| 结论 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 发表论文和参加科研情况说明 |
| 致谢 |
（9）基于基因组测序信息的西瓜种脐斑性状的精细定位（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 第一章 引言 |
| 1.1 西瓜介绍 |
| 1.1.1 西瓜简介 |
| 1.1.2 西瓜种质资源介绍 |
| 1.2 西瓜表型性状的遗传分析与基因研究 |
| 1.2.1 西瓜叶片的遗传分析与基因研究 |
| 1.2.2 西瓜抗病性的遗传分析与基因研究 |
| 1.2.3 西瓜果实的遗传分析与基因研究 |
| 1.2.4 西瓜种子性状的遗传分析与基因研究 |
| 1.3 RAD-seq技术 |
| 1.3.1 RAD-seq介绍 |
| 1.3.2 RAD-seq技术的应用 |
| 1.4 QTL定位技术 |
| 1.4.1 QTL定位技术介绍 |
| 1.4.2 QTL定位的应用 |
| 1.5 DNA分子标记技术 |
| 1.6 研究目的、意义及内容 |
| 1.6.1 研究目的、意义 |
| 1.6.2 研究内容 |
| 1.7 实验技术路线 |
| 第二章 西瓜种脐斑性状的表型遗传分析 |
| 2.1 引言 |
| 2.2 材料与仪器、试剂 |
| 2.3 实验方法 |
| 2.4 结果与分析 |
| 2.5 小结与讨论 |
| 2.5.1 小结 |
| 2.5.2 讨论 |
| 第三章 西瓜种脐斑性状基因的初定位 |
| 3.1 引言 |
| 3.2 材料与仪器、试剂 |
| 3.2.1 材料 |
| 3.2.2 主要试剂和仪器 |
| 3.3 实验方法 |
| 3.3.1 DNA的提取与检测 |
| 3.3.2 RAD测序与数据分析 |
| 3.3.3 遗传图谱的构建 |
| 3.3.4 QTL定位 |
| 3.4 结果与分析 |
| 3.4.1 RAD测序与数据分析 |
| 3.4.2 遗传图谱的构建 |
| 3.4.3 QTL初定位 |
| 3.5 小结与讨论 |
| 3.5.1 小结 |
| 3.5.2 讨论 |
| 第四章 西瓜种脐斑性状基因的精细定位 |
| 4.1 引言 |
| 4.2 材料与仪器、试剂 |
| 4.2.1 材料 |
| 4.2.2 主要试剂 |
| 4.2.3 主要仪器 |
| 4.2.4 实验试剂配制 |
| 4.3 实验方法 |
| 4.3.1 西瓜DNA的提取 |
| 4.3.2 Indel分子标记的开发与引物的PCR扩增 |
| 4.3.3 8%聚丙烯酰胺凝胶电泳的检测 |
| 4.3.4 数据分析与定位区间的压缩 |
| 4.3.5 候选基因的预测分析 |
| 4.3.6 候选基因上设计引物进行验证 |
| 4.4 结果与分析 |
| 4.4.1 使用Indel分子标记逐步缩小定位区间 |
| 4.4.2 种脐斑候选基因预测 |
| 4.4.3 候选基因上开发标记在群体内验证 |
| 4.5 小结与讨论 |
| 4.5.1 小结 |
| 4.5.2 讨论 |
| 第五章 qRT-PCR验证候选基因 |
| 5.1 引言 |
| 5.2 材料与仪器、试剂 |
| 5.2.1 材料 |
| 5.2.2 主要试剂 |
| 5.2.3 主要仪器 |
| 5.3 实验方法 |
| 5.3.1 基因型鉴定 |
| 5.3.2 RNA提取 |
| 5.3.3 反转录成cDNA |
| 5.3.4 候选基因qRT-PCR特异性引物的设计 |
| 5.3.5 qRT-PCR反应 |
| 5.4 结果与分析 |
| 5.5 小结与讨论 |
| 5.5.1 小结 |
| 5.5.2 讨论 |
| 第六章 分子标记资源群体的应用 |
| 6.1 引言 |
| 6.2 材料与仪器、试剂 |
| 6.2.1 材料 |
| 6.2.2 实验仪器、试剂 |
| 6.3 实验方法 |
| 6.4 结果与分析 |
| 6.5 小结与讨论 |
| 6.5.1 小结 |
| 6.5.2 讨论 |
| 第七章 结论与展望 |
| 参考文献 |
| 个人简历、硕士期间发表的学术论文以及研究成果 |
| 致谢 |
（10）西瓜抗枯萎病苗期性状的选择（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料 |
| 1.2 喷施H2O2 |
| 1.3 红外线温度计比较温度差异 |
| 1.4 用显微镜观察叶片背面的气孔面积和毛状物数量 |
| 1.5 数据处理 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 抗病西瓜品系与非抗病西瓜品系在温度上的差异 |
| 2.2 抗病西瓜品系与非抗病西瓜品系在气孔面积上的差异 |
| 2.3 H2O2处理对抗病西瓜与非抗病西瓜品系毛状物数量的影响 |
| 3 结论与讨论 |
四、西瓜标记性状的类型及其应用（论文参考文献）
- [1]冬瓜果实形状的遗传分析与基因定位[D]. 陈婕英. 广西大学, 2021(12)
- [2]诱导四倍体马铃薯优良品种合作88降倍及其机制研究[D]. 郑英转. 云南师范大学, 2021(08)
- [3]甜瓜果柄长度QTL位点的初步分析[D]. 范磊. 黑龙江八一农垦大学, 2020(09)
- [4]西瓜糖含量配合力分析及分子标记辅助选择[D]. 蔡佳秀. 东北农业大学, 2020(05)
- [5]西瓜短蔓基因Cldf的图位克隆[D]. 朱春雨. 西北农林科技大学, 2020
- [6]西葫芦PRSV-W抗病基因紧密连锁分子标记的开发与育种应用[D]. 王凯玥. 河北工程大学, 2020(02)
- [7]美洲南瓜全基因组SSR标记的开发和遗传多样性的分析[D]. 武向斌. 河南农业大学, 2019(04)
- [8]甜瓜重要性状分子标记辅助育种体系的建立[D]. 张乔玲. 天津大学, 2019(06)
- [9]基于基因组测序信息的西瓜种脐斑性状的精细定位[D]. 张晓雨. 郑州大学, 2019(08)
- [10]西瓜抗枯萎病苗期性状的选择[J]. 屈海泳,张朝阳,刘连妹,王永章. 江苏农业科学, 2017(22)